茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。边境能保护我们的总部免受由加洛普拉领导的袭击吗？加洛普拉正在领导大量的提埃纳人！？随着动画的发展，动画世界变得越来越热闹。
