晴朗的一天,悟饭和比迪丽正在教室上课,这是接到一条求助信息。原来有个老头准备跳楼自杀,他们连忙化身赛亚超人前去营救。从这个奇怪的老头口中,他们得知距今一千五百年前,南银河科纳兹星球曾有一名超级英雄塔皮欧,后来不知何种原因被困在音乐盒中。为了报答自己的罪过,挽回失去的一切,兄弟俩踏上了寻找传说中的“哲人石”的旅程。几年后,一位右臂和左腿都被“机械盔甲”取代的国家炼金术士出现在人们面前。他被称为“钢铁的炼金术”。