17岁少女榆野卯月（松隆子 饰）从北海道独自来到东京的武藏野大学读书。她需要独自面对新的城市，新的生活，新的环境，她到了学校也非常羞涩，同学们纷纷讨论为何会来武藏野读书，其实她来到这里的一个重要原因是因为她一直暗恋一个名叫山崎的男孩子。
被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”，并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。
这部作品改编自《银河系之战：大阴谋》，讲述了银河系英雄与绝对人之间的决定性战斗的故事，震惊了银河系。与此同时，新的奥斯曼战士雷古鲁斯·奥斯曼和绝对战士暗黑破坏神也将出现。
