传说中的宝藏,可以实现持有者的所有愿望——圣杯。获得圣杯的仪式被称为圣杯斗争。参加圣杯竞赛的圣杯选出的七名魔术师被称为领主(英语大师),他们与七名被称为仆人(英语仆人)的魔术师签订合同。他们是被圣杯选中的七个灵魂,分为七个等级,被召唤为恶魔。故事发生在一年的战争期间,与第一代高达的故事相似。前往地球前线工作的年轻联邦军官斯洛·山田在一次偶然的交火中遇到了敌人,基因军的女飞行员艾娜·萨哈林。