这部电影将描绘被称为日本历史上最大谜团的“本能寺事件”的前一天,以及一部追踪这一谜团的历史悬疑电影。故事开始于现代京都,即将结婚的可可(Ayase Yao饰演)正处于人生的岔路口,她住进了一家本能的寺庙酒店。
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥(田村由加莉 配音)、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵(能登麻美子 配音)、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃(钉宫理惠 配音),活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友,过着平凡的校园生活,但每当夜晚来临,她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标,是寻找价值连城的天使像,邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它,企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人(桧山修之 配音)、随叫随到的万能管家长月平之丞(清川元梦 配音),是他们在背后默默的支持着少女们。