某日，双叶幼稚园的孩子们正在船屋里愉快的玩耍，一位名叫美色（三石琴乃 配音）的神秘人物忽然现身，紧接着，一艘巨大的飞船将船屋整个抓了起来，来不及逃跑的风间（真柴摩利 配音）和小新（矢岛晶子 配音）等人和飞船一起消失在了空中。
深入挖掘事件现场留下的“残余物”的意义，揭示沉默的残余物想要传达的信息。它不仅解决了这一事件本身，还安抚了幸存者的情绪。刑警部门的村上聪（由内川隆饰演）以其极端自律和不善于观察的令人难以置信的个性俘获了许多人的心。
《Union》是曾经风靡一时的多人在线角色扮演游戏，一支全部由小学生组成的名为“昴星团”的队伍是游戏中的霸主，所向披靡无人能敌。然而，一场事故的发生导致了小组中一名成员旭姬（大森日雅 配音）的死亡，导致昴星团解散，游戏也被迫下线。
