2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
沈雪梦想着和她的哥哥达一起过着亲密的高中生活,达也一起上学,但摆在她面前的是一年级和二年级学生之间的高墙——优等生和垫底生!?另一所“魔法高中”是从沈雪的角度生动地描绘出来的,她是一个爱哥哥胜过爱家人的妹妹。