在《Fairy gone》世界中,有着能将妖精作为兵器所操使的“妖精兵”存在。而在故事中,距离战争9年后那不稳定的政局,因战争受到伤害展开复仇的恐怖份子因此出现。曾经帅气开朗的草帽海贼团,由于路飞的胃口太大,现在已经入不敷出。迫于生计,他们向酒吧老板求助。老板引导他们进入一条深而无底的隧道。为了谋生,每个人都勇敢地走向洞穴深处。最后,他们到达了一个非常宽敞的地方,那里聚集了无数海盗团伙。