Order01「とあるバーテンダーの秘め事」 響（和田琢磨）は勤め先のバーの店長・白州（升毅）のカップリングに悩んでいた。従業員の北杜（堀未央奈）を男体化するのはピンと来ず、新たな従業員を雇うことを要望する。
故事发生在不久的将来，地球上人类活动的空间已经到达广阔的外太空。故事的主人公是一位名叫丹迪的宇宙猎人（由水川顺一配音），他也是一位著名的花花公子。他和他的伙伴，旧的清洁机器人QT（由佐藤由纪配音），在宇宙中寻找各种未知的新外星物种。
神秘的EVA Zero飞行员Ayanami在与Ikeyamura达成协议时，抵达了NERV底层的中央教条红池。她的命运似乎要在这里结束了。在关键时刻，川上和美不仅要按照吉信吉的指示完成对“第二次大灾难”和“人类完成计划”真相的调查，还要保护东和秋原，以及防止SEELE与第一架和第二架飞机的身体接触。出于对池原都的仇恨，秋原接受了SEELE引爆MAGI的提议。她能成功吗？为防止人类“终极悲剧”而酝酿的“人类完成计划”，比如与SEELE合作了很长时间的池云田、冬月耕、池吉，能否实现？请在电影《新世纪福音战士》第二部中提供答案。
