“我的名字叫佐藤博文，和往常一样……他是一个“不死之人”，自他一生以来，人们多次回忆起他。“人类臭虫大学”研究所对这种Satake感兴趣。我们正在研究实际发生的奇迹事件以及漩涡中的人类。研究对象佐藤讲述了不朽而不幸的日常记忆。
与此同时，双胞胎连环杀人事件接连发生，姐妹俩陷入了一个黑暗血腥的谜团；单向街：一位离异的记者带着年幼的女儿去郊区采访一位科幻小说家。随着神秘极光的出现，这位记者似乎进入了一条时间隧道，坠入了一个平行的世界；美丽的护士小璐来到某精神病院工作，那里有各种行为怪异的病人，医院背后也隐藏着令人震惊的秘密
她的念头似乎触怒了专横的榭尔，因此惹来杀身之祸。危急之时，芭洛特得到犯罪搜查官乌夫库克博士（八岛智人 配音）的救助，并在马杜克紧急法令09的庇护和允许下，拥有了法令禁止的特殊能力。乌夫库克希望借助少女之手，揭露榭尔一系列的罪行。对她来说，这不啻为一次凶险的旅程…… 本片根据冲方丁的科幻小说改编，为“壳中少女”三部曲中的第一部（另两部分别为“燃烧”和“排气”）。
