在故事“武士大选”之后。他二十五岁。由于武士女孩的活动,覆盖日本的威胁消失了,人们恢复了平静的生活。然而,在Yagyu道场,这与这些人的和平本性背道而驰。
为了见到父亲,为了得到父亲的爱,她们坚信只要将姐妹体内的蔷薇圣母聚集到一起,便可以进化成为爱丽丝。罗真制造的七个蔷薇少女的传说,最终演变成一场她们自相残杀的战斗,但是这场战斗有个美丽的名字——Alice Game。就这样作为唯一的梦想,唯一活着的理由,她们不断觉醒又不断沉睡,与不同人缔结契约,在N之梦境中不断寻找姐妹战斗。
在遥远的未来,世界人口在达到峰值后将开始呈现下降趋势。为了确保物种的繁荣和生存,人类创造了用于管理生态系统的人工智能,并进行了“人类多样性实验”。