６人は転校前に「タイムカプセルを埋める約束」をするものの、 結局その約束を叶える事が出来ないまま離ればなれになってしまう。 そして４年後、成長してそれぞれの日常を送っていた。 それぞれに悩みや不安を抱えて、日々を過ごしていたある日 そんな彼女等にある奇跡が起こる・・・・・
美绪介绍下，他们认识以画富士山闻名的画师如月峰水、市议员大木岩松、双塔的设计者风间英彦（森谷帝二的弟子，第一弹《引爆摩天楼》中，森谷曾向新一挑战）、天才程序员原。期间灰原的举动异常。 大木提前入住B塔被害，目暮警官着手调查发现他与美绪似有不同寻常关系，不久原亦被杀害于家中。因为现场都留有与日本画画师作画时所用的乳钵相似的小酒杯碎片，两起案件似系一人所为。柯南由小酒杯联想到灰原曾效力的、以酒名为绰号的黑暗组织，并注意到第二起案件中碎片上未沾染血迹。与此同时他找到灰原举动异常的原因，却发现她正被人追踪。而园子玩笑弄的发式令她像极了雪莉（灰原）。 开幕酒会上，美绪向宾客展示如月最为宝贵的富士山画作时被杀，死相正如横亘在富士山正中的双塔的缩影图，她的身下也有一个小酒杯，不过却是完好的。地上一颗原本该呆在美绪脖子上的珍珠令柯南将目光转向如月。紧接，A楼美绪公司电脑档案所在的楼层及地下配电室发生爆炸。逃亡时刻，柯南注意到正有一支枪瞄准园子，心中给出了所有疑问的答案，但他及小兰等人最迫切需要解决的却是如何从火海逃脱。
没想到，就在她出发的前一天，一场抢劫让她失去了所有积蓄，美国梦也破灭了。一个名叫乐高的女孩（佐藤康介饰演）目睹了抢劫，丽莎的不幸经历深深打动了她。她决定用自己的努力帮助那个可怜的女孩。在乐高的带领下，丽莎遇到了能干的Junko（佐藤仁美饰演）筹集资金。三个女孩都失去了理智，但她们不知道的是，真正的麻烦和危险正在慢慢逼近。
