第三季的故事将讲述在前二季动画中，经过前所未有的激烈战斗后第三十届「QUEEN’S BLADE」最终结束。 前任女王，逢魔女王阿尔德拉被打败了，新一任的女王由雷云之将克劳迪特上任。 本身被公认是人格高尚的克劳迪特成为女王之后却性格大变，让整个大陆陷于战火的地狱之中。为了对抗这暴君的暴政及抹去人民的絶望，骑士公主安妮洛特便展开行动，与跟自己结成义姐妹的美斗士一起，扬起叛乱军的正义旗帜。安妮洛特与克劳迪特的战斗就此不可避免地终将展开，喜欢「女皇之刃」系列的大家又可以一睹众美少女战士的英姿了。
有一天，她遇到了一个叫前野新一（Keiyama Xiu配音）的男人，并同意和他一起寻找他的真实记忆，青山制药神山研究所立即浮出水面。在调查过程中，一位名叫Lola（由Ohara Sayaka配音）的红发女子突然袭击了Yan，并在暗杀失败后继续追捕她。与此同时，索茶山边缘神秘的白发男孩Ayebus（石田明配音）和Sayello（田中龙树配音）一个接一个地出现在Ryo的身边，接连的死亡也给她带来了不好的预感。在希腊传说中，命运之神生下了七个女儿，在这一刻，命运之上帝的女儿们能逃脱命运吗。
