在不久的将来，为了治疗现代人越来越多的严重精神疾病，总部位于东京的精神病学研究所开发了一种可以反映他人梦境的机器。在微型直流电的帮助下，梦会出现在监视器上，从而更容易找到一个人焦虑的根本原因。
季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
