在与戈鲁戈姆战斗后半年,本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下,但光太郎不答应,于是杰克将军便将其变身机能破坏。 变身机能破坏的情况下,光太郎被扔往宇宙。
而封刃师正是拥有看见这世间的污秽并将其封印的人,只是这行侠仗义背后的牺牲远比想象的更加无情……
这一次,《公安九课》帮助《公安六课》秘密解决了一名程序员逃往另一个国家的麻烦和琐事,还卷入了传说中的黑客“傀儡老师”的犯罪事件。就在行动陷入僵局的时候,木偶老师竟然不请自来,出现在了公安九班!苏西和她的同志们在不知不觉中卷入了一场涉及政府的阴谋。