曾经的中二病深度患者佐藤一郎(岛崎信长 饰),再升入高中后痛改前非,决定过回普通高中男生的生活。然而平凡的日子并未持续多久,某晚一郎为了取会忘记的东西返回校舍,结果在走廊里见到了面无表情、衣着古怪的同班同学佐藤良子(花泽香菜 饰)。
ちょうどその時メルフェアランドでも、この世界のクイーンズブレイドが開催されようとしていた。 アリシアは元の世界へ帰る方法を探すのだが・・・
4人の「王」が交錯した学園島事件以降、白銀のクランズマンである夜刀神狗朗とネコは、生死不明となった主であり「白銀の王」のであるシロの行方を追っていた。しかし、なかなかその手がかりをつかめず、気を落としていた2人は、「赤の王」を主とする能力者集団「吠舞羅(ホムラ)」のメンバーである鎌本力夫と櫛名アンナが、何者かに追われている場面に遭遇し……。監督はテレビ版に続き鈴木信吾、アニメーション制作は「マルドゥック・スクランブル」のGoHands。