在“超级大学级别的绝望”带来的“人类历史上最伟大、最令人发指的绝望事件”下，世界陷入了崩溃边缘的绝望境地。为了拯救这个充满绝望的世界，由希望峰学校前校长和师生组成了“未来机构”。其中有78名学生，其中包括曾击败江之岛敦子的苗木成等人。
它以古都金泽为舞台，告诉了她再次不择手段攀登顶峰的故事。
幸存的人们建造了三堵巨大的防护墙，以防止巨人的入侵，并在这个与世隔绝的环境中享受了百年的和平。然而，作为“和平”的代价，人类已经失去了走出围墙的“自由”，像圈养的动物一样平静地生活。主人公艾伦·耶格尔对他尚未见过的外部世界感兴趣，但也渴望人类失去的“自由”。与大多数害怕巨人、盲目相信墙可以保护自己的安全并愿意在墙内生存的人类不同，他探索墙外世界的想法被认为是异端。十岁那年，当人们已经安逸了100年的时候，艾伦·耶格尔突然出现了一个前所未有的60米高的“超级巨人”，以压倒性的力量摧毁了城墙。之后它立即消失了，巨人们成群结队地冲进墙里捕食人类。
