故事发生在19世纪中叶的日本德川幕府时期，位于镰仓的东庆寺得到幕府的支持，可以向饱受苦难婚姻折磨的女性施以援手，帮助他们成功和夫家断绝关系。这一日，不法商人堀切屋三郎卫门（堤真一 饰）的小妾阿吟（满岛光 饰）以及被混蛋丈夫（武田真治 饰）残酷剥削的铁匠阿茹（户田惠梨香 饰）结伴来到东庆寺，并且认识了寺脚下御用宿柏屋主人源兵卫（树木希林 饰）的外甥信次郎（大泉洋 饰）。信次郎是一名见习医生，他利用医术尝试着治疗阿茹的烧伤，同时希望记录下女性们的遭遇写出传世剧本。有着不同背景的女性们相继前来，她们共同站在了人生的岔路口上…… 本片以井上厦的小说《東慶寺花だより》为参考改编而成。
然而，医生仍然无法接受失去孩子的痛苦，也无法正确治疗阿童木，因为他认为阿童木不是人而抛弃了他。阿童木成了一个无家可归的流浪者，也被各地的军队通缉，最终被抓获。军方要求天马博士去除阿童木的能量，并将其转化为军用机器人的能源。在最后一刻，天马医生突然醒来，协助阿童木逃跑。面对军方的追击和拦截，阿童木奋起反抗，最终，一场惊天动地的战争迫在眉睫。在不断旅行的过程中，阿童木逐渐长大，他也接受了自己将机械与人类结合的设计，肩负起了全人类生存的责任。
