一千年过去了，在一次任务中，海豹突击队队员尼克（汤姆·克鲁斯饰演）意外闯入了地下的一座古墓，唤醒了阿曼内特的灵魂。回到人类世界后，阿曼内特决定用尼克的身体作为死神赛斯的灵魂容器，并重新获得在这个新世界成为国王的野心。为了阻止Amanett的阴谋，Nick和考古学家Jenny（Annabelle Wallis饰演）联手对抗木乃伊大军。面对凶猛的阿曼内特，尼克能否取得最终胜利，拯救人类？
故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界，武力的最高境界从使用利剑，转而到使用魔法，继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完全不会使用枪械，只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”，顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队。某一天，拥有“魔女猎人”资格的超精英持枪高手凤樱花，竟然加入了这支队伍。在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中，一场学园动作奇幻大作就此开始。
主角色丞狂介是个拳法部的高中生，同时继承刑警父亲和SM女王母亲血统的他，充满正义感的同时，在把小裤裤套上脸时则又会变成拥有超人能力的疯狂假面。
