在这个世界上,有一些人可以长生不老。即使他们受了致命的重伤,他们也会在短时间内迅速康复,人们称他们为“亚人类”。长井惠(由宫野正雄配音)是一名普通的高中生。一天,一场车祸暴露了他的亚裔身份,他立即被政府相关部门高价通缉。14年前,第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击,在世界上引发了前所未有的动荡。之后,前NERV成员,如葛成梅丽(三石琴配音)逃离并建立了Wille,Wille反抗Seele和NERV。