他逐渐融入了当地淳朴平和的生活，并与擅长烹饪、喜欢恶作剧的毕奶奶（葵惠子饰演）成为了朋友。毕奶奶每天都邀请凌雄来她家享用美食，两人一起去山谷等待月亮的彩虹。有一天，灵雄遇到了活泼微笑的女孩Marleya（长谷川饰），她很快成为了他生命中的阳光。由于被忽视，毕的婆婆很不高兴，但凌雄完全没有意识到。生日那天晚上，凌雄带玛丽亚去婆婆家吃晚饭。玛丽亚因婆婆对烹饪过敏而住进了医院。凌雄打电话询问婆婆，但发现婆婆突然失明。与此同时，凌雄工作的电影院正面临关闭。在夏威夷的微风中，男孩静静地体验着成长的选择。这部电影改编自吉田令雄的同名散文故事书，根据作者的个人经历写成，书中的许多角色实际上都存在。小泉今天演唱了主题曲《彩虹消失了》，她和作者是多年的好朋友。
而长距离亚空间航行所引发的时空歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯拉袭击的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯拉。 但喜悦并未持续多久，深藏地下的真正哥斯拉“哥斯拉·地球”现身了。两万年间持续成长生存、身高300米、质量超过10万吨，在进化成这种姿态的超巨大哥斯拉压倒性的破坏力面前，晴男等人落花流水。 拯救了晴男的是被视为人类的残存者“弗图亚”之民，米亚娜。弗图亚是他们在这个地球首次遇到的人型生命种族。他们会是人类的子孙吗——。“弗图亚的神也被哥斯拉击破，如今只剩下卵。挑战者、抗争者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这样的他们，晴男回应道“这是以人类的双手夺回地球的最后机会了”。 另一方面，比尔沙尔德的指挥官·加尔格，注意到弗图亚使用的箭头是由“自律思考金属体·纳米金属”所制造而欢喜。这和21世纪他们在富士山麓作为“对哥斯拉决战兵器”所开发、在启动前遭到破坏的“机械哥斯拉”由同种物质所构成。这正是当时的开发设备至今仍然残存的证明——。
小田切双叶（金泽舞 配音）个性活泼开朗，有着超级旺盛的食欲的她曾经在数家店面里创下过大胃王挑战的记录，双叶不仅仅爱吃，在烹饪上也是一把好手。叶山照（今村彩夏 配音）表面看似成绩优异的乖乖女，实际上却有着非常腹黑的一面，每一天都在扮演着好学生的角色。这三个名字里都有“叶”的女孩成为了朋友。
