一个名叫克鲁贝洛斯(由久川雅雅配音)的会说话的玩偶出现在她面前。小可告诉她,他是守护这本书的神兽,书中封印着一种名为库洛牌的东西。现在封印解除了,它希望小樱成为一名库罗法师,并将帮助她恢复这些制造麻烦的库罗牌。第二天,一个叫李晓朗(由熊井素子配音)的转学生被调到了樱花的班。这个看起来很酷的男孩也是冲着库罗牌来的。随着库罗牌的封印,越来越多的角色出现在小樱身边,但他们的真实目的仍然未知。
电影版的舞台是在梅志夫离开该部门两年后。被调到冈山县濑户的美池夫开始为这位历史上最年轻的防卫大臣的受伤负责。在调查事件背景——“宙斯盾”舰相撞事件期间,由于航行内容属于国家机密,“传宗刀”的“授权发射”无法使用。