之后,一个神秘的环保组织SKBE掳走了小新一家人,而为首的,竟然是双叶里的里长四膳守(山寺宏一 配音)。原来,四膳首是一位激进的环保主义着,妄图通过一种神秘的药物将破坏环境的人类全部都变成动物,而小新捡到的神秘液体就是还尚处于测试阶段的药物,四膳守准备将美伢和广志当做实验对象进行研究。在神秘女子维多利亚(后藤邑子 配音)的帮助下,小新一行人成功出逃,他们和春日部防卫队一起,决心破解四膳守的阴谋。
Miyako Shin本应成为新宿区政府的一名普通公务员,却被派往东京23个区的所有区都不知道的“夜间地区交流部”工作。这项工作涉及解决由各种怪物引起的超自然事件。
在一家汽车修理厂工作的西泽尚志(佐藤贤三饰演)看起来像一个迟钝无味的年轻人。他和其他男孩参加了一次社交聚会,一次偶然的机会,他认识了聚会上的女孩中原麻衣(拓谷泰丰饰演)。