三成美琴（石原龙美饰演）是一名在民间法医组织“UDI”工作的女法医，该组织专门接收因异常原因死亡的尸体，并对其进行解剖以查明案件真相。与美琴合作的还有法医中田实（井浦信饰演）、录音师京部龙郎（和田正雄饰演）和检验技师西子德海林（石川茂饰演）等。虽然中肠科有着丰富的临床经验，但其性格却古怪古怪。梅琴和中殿之间往往存在着不可调和的矛盾，它们对正义和法律有着不同的理解。事实上，中殿里有一个不为人知的秘密。他的女友不幸死于一场“意外”，但各种线索向纳夫透露，是一名连环杀手夺走了她的生命。中殿坚定不移地留在UDI，无所畏惧，正是为了找到杀害女友的凶手。
世界观故事发生在一个既不能确定时间也不能确定地点的未来主义世界。世界是由高度发达的网络（软件）和超级计算机（硬件）组成的，它们是现实的载体。人类本应从技术的繁荣和发展中受益，但由于一场灾难，他们失去了连接互联网的资格和能力（相当于公民身份）。
因为希望引起美丽女孩赤木晴子的注意，曾经的不良少年樱木花道加入湘北篮球队，展开了全新的青春人生。在与陵南的艰苦对决过后，樱木迎来了人生的第二场比赛，对手是女生人数超过70%的武园学园高等学校，因为男生少，武园篮球部的男生分外努力，而他们的女子啦啦队也格外热情高涨，因此武园篮球部可谓实力和人气兼备的超级对手。在比赛前，樱木重逢初中时代表白后曾拒绝他的女孩叶子，叶子爱慕武园的9号球员小田，他们和樱木出自同一学校。小田视篮球如生命，他坚决反感樱木这样的坏小子进入球场。旧日同窗重逢，交织着各样情感的比赛由此展开…… 本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第一部剧场版。
