混血儿羽濑川小鹰(濑户康史 饰)因为天生金发和眼神凶狠的原因,所到之处总会引来不必要的纷争和误解。他转学至圣克罗尼亚学园高中部已经三个月,却始终独来独往,没交到一个朋友。
在前一部作品中扮演学生水野直美的长泽亚美预计也将回到母校担任教师。
数年后,在人类与“柱”持续战斗的天空中,身披战翼的女武神们以及支援者女武神的男人们,为了拯救世界而拼上性命翱翔天际。日本也不例外,与耸立于灵峰富士的巨大柱对峙的3名女武神。她们每个人都具备强劲的能力,但却都是些问题儿童。此时,一位王牌飞行员因某些缘由从欧洲前来…… “来吧,是反击的时候了,人类。终将来临的决战之日——诸神的黄昏已近在眼前。”