第三季的故事将讲述在前二季动画中,经过前所未有的激烈战斗后第三十届「QUEEN’S BLADE」最终结束。 前任女王,逢魔女王阿尔德拉被打败了,新一任的女王由雷云之将克劳迪特上任。 本身被公认是人格高尚的克劳迪特成为女王之后却性格大变,让整个大陆陷于战火的地狱之中。为了对抗这暴君的暴政及抹去人民的絶望,骑士公主安妮洛特便展开行动,与跟自己结成义姐妹的美斗士一起,扬起叛乱军的正义旗帜。安妮洛特与克劳迪特的战斗就此不可避免地终将展开,喜欢「女皇之刃」系列的大家又可以一睹众美少女战士的英姿了。
故事从在九州乡下长大的浅葱空豆(广濑铃 饰)与梦想成为音乐家的青年海野音(永濑廉 饰)的命运般的相遇开始。原本以为一辈子都不会再见面的两人却在东京一处开始了合租生活,他们早已坠入爱河,却没有开始恋爱,仿佛处在白天和黑夜之间的暧昧而耀眼的“黄昏时分”。